Chapitre 16

Pharmacogénétique et pharmacogénomique

PLAN DU CHAPITRE

Définitions 

Génétique et médicament 

Prérequis et objectifs

Prérequis

 Notions de pharmacologie

Objectifs :

À l’issue de ce chapitre vous serez capable de :

 Donner la définition de la pharmacogénomique/pharmacogénétique

 Citer les grandes mutations impactant le médicament

Définitions

Il n’existe pas de consensus pour distinguer la notion de pharmacogénétique de la notion de pharmacogénomique. Nous proposons dès lors des définitions les plus larges possibles. Cependant il est très courant dans la littérature d’utiliser indifféremment l’un ou l’autre des termes de façon univoque (figure 16.1).

Figure 16.1 Pharmacogénomique, pharmacogénétique © Mathieu Guerriaud

Pharmacogénomique

C’est une discipline très large aux contours flous qui englobe à la fois la pharmacogénétique et la pharmacogénomique d’expression. Au niveau français on la défini comme : « l’étude des mécanismes génétiques des variations individuelles de la réponse aux xénobiotiques et, plus particulièrement, aux médicaments. Ces connaissances sont appliquées ou applicables à l’adaptation de certains traitements à chaque patient. ». Au niveau européen, l’EMA la définit comme « l’étude de la variabilité de l’expression des gènes individuels concernant la sensibilité à la maladie ainsi que la réponse aux médicaments au niveau cellulaire, tissulaire, individuel, ou d’une population. »

Pharmacogénétique

Initialement définie comme « l’étude des modifications des réponses pharmacologiques sous l’influence de l’hérédité ». L’EMA la définit comme « l’étude des variations interindividuelle dans les séquences d’ADN relatives à une réponse à un médicament ». Elle ne s’intéresse, en principe qu’à la recherche un polymorphisme génétique germinal et étudie les différents polymorphismes de pharmacocinétique et de pharmacodynamie.

Pharmacogénomique d’expression

De façon très basique, on peut la définir comme « l’étude de l’effet d’un médicament sur un gène ». Au sens où un médicament peut, par son interaction avec son récepteur, activer ou désactiver certains gènes, et ainsi produire une influence initialement inattendue sur le système immunitaire ou encore mitochondrial. Ces voies ne sont classiquement pas étudiées par la pharmacogénétique.

Pharmacogénomique tumorale

Elle s’intéresse au génome tumoral, pour y étudier les gènes codant pour des cibles thérapeutiques spécifiques ou encore des voies métaboliques.

Génétique et médicament

Remarque

La plupart des variations génétiques chez l’homme sont dues à des mutations d’un seul nucléotide dans l’ADN, on parle de SNP : single-nucleotide polymorphism.

Historiquement, la pharmacogénétique est née en 1956 quand Carson découvre que les patients traités pour le paludisme par primaquine ayant une anémie sont atteints d’un déficit en G6PD. C’est à peu près au même moment que l’on établit que ce déficit et une pathologie connue depuis l’Antiquité, le favisme, sont une seule et même maladie. Le séquençage du gène codant le déficit en G6PD ne sera réalisé que 30 ans plus tard, en 1986.

La connaissance d’une mutation permet de modifier la façon dont on va traiter un patient, ainsi en 2011, plusieurs tests permettent cela comme en témoigne le tableau 16.1.

Tableau 16.1

Tests génétiques recensés par l’Agence de biomédecine ayant trait à la pharmacogénétique

Numéro ORPHA	Maladie	Nombre de tests
ORPHA240839	Toxicité du 5-fluorouracile	4 628
	Prédiction de la réponse au traitement Interféron/Ribavirine	3 339
ORPHA240885	Susceptibilité aux effets indésirables graves de l’irinotécan	3 336
ORPHA241005	Susceptibilité au syndrome d’hypersensibilité à l’abacavir	3 140
ORPHA240927	Choix du dosage d’azathioprine dans le traitement de la maladie de Crohn, de la leucémie et dans la transplantation	1 182
ORPHA241043	Choix du dosage de tacrolimus dans la transplantation	1 069
ORPHA240969	Susceptibilité aux effets indésirables graves de l’efavirenz	486
ORPHA3315	Déficit en thiopurine S-methyltransferase	402
ORPHA240925	Choix du dosage de mercaptopurine dans le traitement de la maladie de Crohn, de la leucémie et dans la transplantation	235
ORPHA240959	Susceptibilité aux effets indésirables graves des antipsychotiques	192

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